基因Ⅱ型草鱼呼肠孤病毒的检测引物和探针及检测方法
本发明公开了一种基因Ⅱ型草鱼呼肠孤病毒的检测引物和探针及检测方法。基因Ⅱ型草鱼呼肠孤病毒的微滴式数字PCR检测引物和探针包括:GCRV‑S6‑F3:5'‑GGCTAAGGTTACTCCTGCATTGC‑3';GCRV‑S6‑R3:5'‑ CAGTGGTGACCAAAGTG TTGAGT‑3';GCRV‑S6‑P3:5'‑荧光基团‑ GGTAAACCACTTAGTGCGGAGA ‑淬灭基团‑3'。本发明将GCRV‑S6‑R3的3′端第2位碱基设计为简并碱基“Y”、将探针5′端的“C”修改为“G”。修改后的引物和探针并不影响ddPCR扩增效率和特异性,并且该引物用于检测变异毒株具有更高的适用性。