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本发明公开了一种相控阵计算机断层成像方法及系统。该方法通过定位像扫描获取被扫描体的形态，自适应选择相位控制模式，并根据选定的扫描曝光协议生成射线源编号组合，利用管电流脉冲触发选中的射线源曝光，最终对采集数据进行图像重建。本发明通过相控阵技术和灵活的相位控制模式，显著提升了时间分辨率和空间分辨率，同时降低了辐射剂量，因此特别适用于心脏、血管等运动器官的成像，能够减少运动伪影，提高图像质量。