崖州湾国家实验室

本申请涉及基因编辑技术领域，具体涉及一种增强型胞嘧啶脱氨酶、包含其的碱基编辑系统及应用。本申请通过广泛收集并整合了已经公开发表文献中的数据集，这些数据集包含了多个已知酶的序列信息和相关的生物学特征。基于这些数据集，对多种来源的胞嘧啶脱氨酶进行筛选与序列功能比对，结合结构预测与功能验证，成功筛选获得一种来源于比斯克放线多孢菌的、适用于鸡细胞且可实现高效C‑to‑T编辑的胞嘧啶脱氨酶(ch‑YZ88‑CBE)，并构建出具备良好编辑活性与稳定性的CBE系统，为禽类遗传改良、功能基因研究提供关键技术支撑。

本申请提供了一种长片段预扩增巢式PCR扩增子建库及在多倍体基因分型中的应用，属于基因检测技术领域。本申请的技术方案解决了在多倍体作物等复杂基因组中，现有扩增子建库方法无法区分多倍体作物序列高度相似的同源基因，导致非特异性扩增严重、测序Reads无法准确归属、SNP分型错误率高的问题。

本申请提供了一种多倍体作物扩增子建库试剂盒，属于基因检测技术领域，该试剂盒包括检测多倍体作物的长片段引物对，长片段引物对的设计方法，包括对目标基因和所述目标基因的已知同源基因进行多序列比对，识别差异位点，在包含≥2个所述差异位点的目标区域设计长片段引物对，使长片段引物对的3’端至少覆盖1个所述差异位点；目标基因来源于多倍体作物；差异位点包括SNP或Indel；长片段引物对用于扩增所述目标区域。本申请提供的一种多倍体作物扩增子建库试剂盒可以解决多倍体同源基因区分难题，操作便捷，即开即用、测序平台兼容性好、酶选择灵活、成本可控、支持高通量样本检测，且作物使用范围广。