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本发明公开了基于大数据的制造业研发全流程财税风险预警管理系统，本发明涉及大数据处理与财税风险管控技术领域，包括数据采集模块、风险指标模型和预警输出模块，所述数据采集模块用于获取企业财务数据、业务数据及税务数据，所述风险指标模型用于对数据进行阈值比对，所述预警输出模块用于在检测到超标时触发预警提示。该基于大数据的制造业研发全流程财税风险预警管理系统，解决了共用产线、人员多项目交叉等复杂场景下每一笔费用无法精准归属至单一研发项目的难题，实现了从财务数值回溯至设备运行曲线、物料流向图谱与人员时空轨迹的全链路闭环追溯，为风险指标模型提供了可信赖的数据基础。