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本发明公开了一种面向分布式光伏富集馈线的小水电动态补偿调峰控制方法，包括：预测分布式光伏富集馈线次日各个时间点的光伏出力、馈线负荷小水电来水流量；结合小水电基准发电功率，计算馈线每个时间点的光伏弃电功率和负荷切除功率，计算小水电动态补偿价格，建立小水电发电收益模型；计算次日各时间点的可行出力区间；构建小水电优化运行模型，求解小水电优化运行模型得到次日各个时间点的小水电最优出力计划；基于当前时刻实际水位和小水电最优出力计划，计算后续各时间点的水位最大值和最小值；当水位最大值或最小值超出预设的安全阈值范围时，触发自适应修正机制。本发明具有实现小水电水资源高效利用等优点。