元码基因科技（北京）股份有限公司

本申请涉及生物信息学与医学影像计算技术领域，具体涉及一种基于空间转录组数据的细胞分割方法、设备及存储介质。本申请的方法包括：获取目标组织的染色图像和基因表达数据；基于染色图像的形态学先验自动生成包含采样点指向细胞核中心的空间方向标签的无监督训练样本；利用双模态特征提取网络深度融合采样点的基因表达特征和局部图像形态特征，联合预测采样点属于细胞内的概率及指向细胞核中心的方向类别；确定方向向量，通过梯度流迭代追踪将采样点向细胞核中心汇聚以生成细胞分割结果。本申请不依赖标注数据，克服了简单通道拼接的信息利用不足，实现连续细胞边界重建，显著提升了转录本捕获效率、高亮度区域识别率与同类细胞基因表达一致性。