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本发明涉及医疗数据处理技术领域，公开了一种斜视手术风险数据评估方法及系统。方法包括：获取患者状态数据和若干候选手术参数集；对患者状态数据进行质量处理，并基于质量处理结果提取斜视稳定性特征；基于质量处理结果及斜视稳定性特征对患者状态数据进行特征处理，生成严重度特征向量；将斜视稳定性特征、严重度特征向量和各候选手术参数集输入至预设融合模型，得到各候选手术参数集对应的综合风险结果。本发明的方案解决了手术方案评估维度单一、无法量化比较等技术问题。