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一种基于超高深度测序的微小残留病灶检测方法及系统
发明专利有效
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§ Ⅰ
卷宗概要
发明人
刘丹; 范锐; 张亚晰; 刘异倩; 马领然; 陶威; 徐丽娣; 黄宇; 陈维之; 杜波
IPC 分类
G16B 20/20 (2019.01)G16B 35/00 (2019.01)G16B 20/30 (2019.01)G16B 20/50 (2019.01)
本发明公开了一种基于超高深度测序的微小残留病灶检测方法及系统,涉及微小残留病灶智能化检测技术领域,包括以下步骤:基于测序文库,按照样本索引进行拆分获取待测样本,并根据待测样本的分子标识符,得到共识序列;基于共识序列,通过过滤掉质量值小于25或者家族大小小于3的共识序列,联合变异类型和距片段边缘距离作为引入原始核酸分子链上的噪音;上下文序列(context)以及链方向作为引入PCR扩增捕获水平的噪音;基于噪音水平,结合肿瘤先验知识,估计循环肿瘤DNA水平,通过检验分子信号来源的显著性,从而确定MRD状态。本发明提高了MRD检测的灵敏度和特异性。