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多切片空间转录组空间域识别方法与系统
发明专利有效
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§ Ⅰ
卷宗概要
发明人
高琳; 闫育青; 胡宇轩; 叶育森
IPC 分类
G16B 40/00 (2019.01)G16B 40/30 (2019.01)G06F 18/23 (2023.01)G06N 3/042 (2023.01)G06N 3/045 (2023.01)G06N 3/098 (2023.01)G06F 18/213 (2023.01)G06N 3/094 (2023.01)G06N 3/0455 (2023.01)G06N 3/0464 (2023.01)G06N 3/084 (2023.01)
本发明具体涉及一种多切片空间转录组空间域识别方法,包括:将多个切片的空间转录组数据进行预处理,并基于空间坐标构建无权无向图,将每张切片建模为属性图;构建融合图注意力自编码器与对抗模块的联合学习模型,利用图注意力机制从基因表达及空间邻域中提取节点低维嵌入表示,通过基于Wasserstein距离的对抗训练策略引导编码器提取跨切片共享特征信息;为提升模型对大规模图数据的适应能力,引入基于邻居采样的子图训练机制;通过对嵌入表示进行聚类,实现多切片空间域的联合识别。本发明利用切片内和切片间的有效信息,在准确识别共有空间域的同时识别出不同切片的特有结构,且训练效率高,适用于大规模空间转录组数据的联合分析任务。