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一种单细胞聚类分析方法及工具
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§ Ⅰ
卷宗概要
发明人
伍科兆; 孟令章; 叶琨; 董光辉; 王磊; 宋健; 董小锋; 林文贤; 张霞敏; 毛秀丽; 梁丽霞; 贺婉婷
IPC 分类
G16B 40/00 (2019.01)G16B 20/30 (2019.01)G16B 45/00 (2019.01)G06F 18/241 (2023.01)G06F 18/2135 (2023.01)G06F 18/23 (2023.01)
本发明公开了一种单细胞聚类分析方法及工具,涉及单细胞测序数据分析技术领域。本发明包括如下步骤:步骤1.细分聚类:从Seurat对象中提取特定的细胞簇,并在不同的分辨率和PCA维度设置下进行二次聚类,利用Seurat的降维和邻域检测算法对细胞进行重新分类,以识别隐藏的亚群结构;步骤2.标签映射与整合:将细分后的聚类结果映射回原始Seurat对象,并创建一个新的refined_clusters列,原始聚类标签和新标签共存,允许在分析中灵活切换不同的聚类方案。本发明支持自定义聚类分辨率和PCA维度,能根据不同数据集和研究目标灵活调整参数;细分后的亚群标签与原始Seurat对象无缝整合,同时保留原始分簇信息,便于后续分析;提供与Seurat完美兼容的可视化功能,支持细分结果的直观展示和比较。