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一种基于测序技术模拟脉冲场凝胶电泳条带的方法和装置

发明专利有效
9权利要求 · 3 独立
§ Ⅰ

卷宗概要

申请人

浙江省疾病预防控制中心(浙江省预防医学科学院); 杭州柏熠科技有限公司

发明人

张严峻; 徐兴宇; 张云怡; 陈建才; 毛凌峰; 倪莉丽; 施觉亮

IPC 分类

G16B 20/30 (2019.01)C12Q 1/6869 (2018.01)G16B 40/00 (2019.01)G16B 45/00 (2019.01)

本申请提供一种基于测序技术模拟脉冲场凝胶电泳条带的方法和装置。本申请提供的基于测序技术模拟脉冲场凝胶电泳条带的方法,包括:获取待分析生物样本的纳米孔测序数据,并基于纳米孔测序数据组装获得基因组序列;根据限制性内切酶的序列特征,从基因组序列中识别限制性内切酶对应的酶切位点;在酶切位点为经过甲基化修饰的酶切位点时,将该酶切位点去除,得到剩余酶切位点;根据所有剩余酶切位点,计算相邻两个酶切位点的距离差,并将该距离差作为一条模拟条带的分子量;针对每条模拟条带的分子量,确定该分子量对应的条带位置;根据各个条带位置、以及该条带位置对应的分子量绘制模拟脉冲场凝胶电泳条带结果,以准确地模拟条带结果。