一种构建密码子序列优化模型的方法、设备、介质及程序产品

本申请的目的是提供一种构建密码子序列优化模型的方法、设备、介质及程序产品，该方法包括：基于样本蛋白质序列信息以及对应的蛋白质三维结构信息，构建样本蛋白质序列信息对应的图结构信息，其中，图结构信息包括与各氨基酸匹配的节点信息以及与各氨基酸对匹配的边信息；将所述图结构信息输入编码器‑解码器架构的密码子序列优化模型，获取预测密码子序列；基于预测密码子序列与所述样本蛋白质序列信息对应的密码子序列，结合相应的损失函数，进行模型优化，获取已训练的密码子序列优化模型。通过蛋白质的三维结构，帮助模型更有针对性地选择密码子，使模型预测的密码子序列更贴近实际的蛋白质折叠过程，使氨基酸的翻译速度与折叠速度相适配。