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一种诊断胃肠癌的甲基化标志物组合及其应用
发明专利有效
9权利要求 · 4 独立
§ Ⅰ
卷宗概要
申请人
江西美因健康科技有限公司; 首都医科大学附属北京胸科医院; 北京市结核病胸部肿瘤研究所
发明人
易翔; 何玉琦; 郭伟; 王瑞如; 龚雪情; 林舒晔; 朱玲琴; 刘庆花; 康倩
IPC 分类
C12Q 1/6886 (2018.01)G16B 40/20 (2019.01)G16B 45/00 (2019.01)G16H 50/20 (2018.01)
本发明属于生物医药技术领域,具体涉及一种胃肠癌联合诊断的DNA甲基化标志物组合及其应用。本发明采用血液样本进行检测,方便开展,提高临床胃肠癌筛查患者的依从性。本申请发现通过筛选与胃肠癌相关的DNA甲基化区域,并结合机器学习算法进行建模,继而利用通过逻辑回归算法构建了综合性的诊断模型,该模型不仅能实现胃肠癌的联合诊断,还能对癌种组织进行组织溯源,显著提高筛查的性能。在独立外部验证集中,胃肠癌联合诊断灵敏度和特异度分别为86%(95%CI:82%‑89%)和93%(95%CI:88%‑98%),AUC为0.943(95%CI:0.920‑0.966);其中肠癌和胃癌的灵敏度分别为84%(95%CI:79%‑88%)和89%(95%CI:84%‑94%),AUC分别为0.936(95%CI:0.909‑0.962)和0.954(95%CI:0.929‑0.979);明显优于传统血清肿瘤标志物。