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一种外周血中微生物cfDNA定量时识别和排除污染物的方法

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§ Ⅰ

卷宗概要

IPC 分类

C12Q 1/689 (2018.01)C12Q 1/686 (2018.01)C12N 15/11 (2006.01)

本发明提供了一种外周血中微生物cfDNA定量时识别和排除污染物的方法,S1.筛选出外周血与食管‑胃交界腺肿瘤共有细菌,提取细菌核酸;S2.根据细菌的特异核酸序列,设计相应的引物探针组合,利用荧光定量PCR对细菌核酸进行多重扩增;S3.利用R统计软件decontam,对S2中扩增后的特异核酸序列进行统计分类,获得一个统计分类程序;在外周血中微生物cfDNA的样本制备时,加入人工合成的外源DNA,设定一个识别样本混淆方法;S4.通过统计分类程序识别和排除污染物,并对外周血中微生物cfDNA进行定量。本发明方法可对外周血中的细菌核酸进行准确、快速和便捷的检测,同时识别和排除有污染的样本,避免出现检测时的假阳性。