一种基于点云配准的蛋白质冷冻电镜结构组装方法

一种基于点云配准的蛋白质冷冻电镜结构组装方法，属于生物信息学领域，首先，获取去冗余后的冷冻电镜实验密度图及对应蛋白质结构，生成模拟密度图，并进行均匀采样和密度向量计算，转化为点云数据，基于点云数据训练并评估配准网络；然后，利用AlphaFold3预测待组装蛋白质复合物的单链结构，以上述训练数据同样方式进行处理，先最长链进行配准，并使用LBFGS优化算法进行局部优化，若相关系数低于阈值且链包含多个结构域，则通过拆分结构域并独立配准提升精度；最后，按链长顺序逐步将剩余链拟合至密度图。本方法结合点云配准与局部优化，显著提升了低分辨率密度图条件下的蛋白质结构组装精度和速度。