一种菌株水平微生物群落动态分析方法及系统

本申请公开了一种菌株水平微生物群落动态分析方法及系统，涉及微生物领域：利用涵盖16S rRAN基因全长的引物对提取的DNA进行PCR扩增；利用PacBio CCS对扩增产物进行测序，得到测序数据；并对测序数据进行筛选和去噪处理；对目标菌株进行单菌株全长16S测序，构建目标菌株的基因组内异质性16S rRAN特征库；构建ASV与菌株的映射矩阵；在映射矩阵中筛选仅归属于预设单一目标菌株的ASV；统计特异性标志ASV在测序数据中对应的序列读段数据；基于序列读段数量、16S rRAN基因总拷贝数和重复拷贝次数，采用双重权重归一化算法计算微生物群落中目标菌株的相对丰度。本申请提高识别精度。