深圳华大基因股份有限公司

本申请提供了甲基化标志物组及其在尿路上皮癌风险预测中的应用，属于生物技术领域。其中，甲基化标志物组包括：以hg19为参考基因组，具有如1)‑17)所示的染色体区域中的至少之一；1)chr1：119528469‑119530711；2)chr1：36042374‑36043443；3)chr10：112838029‑112838910；4)chr10：105344152‑105344747；5)chr11：2890715‑2891126；6)chr12：54348801‑54349427；7)chr17：40700226‑40700922；8)chr17：41363502‑41364563；9)chr18：46354015‑46354306；10)chr19：45655294‑45657245；11)chr2：63282360‑63284369；12)chr3：147113840‑147115561；13)chr5：140802400‑140802884；14)chr7：27225125‑27225962；15)chr8：57358060‑57359512；16)chr8：57359216‑57359347；17)chr8：144789639‑144790191。基于前述甲基化标志物组进行尿路上皮癌的检测具有高灵敏度、高特异性等优势。

本申请提供了检测尿路上皮癌和前列腺癌的甲基化标志物、试剂盒及方法，属于生物技术领域。其中，前述甲基化标志物包括：以hg19为参考基因组，具有如1)‑2)所示的染色体区域中的至少之一；1)chr8：57357947‑57359481；2)chr22：40081529‑40082209。前述甲基化标志物在尿路上皮癌和前列腺癌的检测中具有高灵敏度、高特异性等优势。

本申请公开了一种甲基化标志物。该甲基化标志物包括：以hg19为参考基因组，具有如下所示的染色体区域中的至少之一：1)chr8:57359229‑57359312；2)chr11:637390‑637481。其中，该甲基化标志物包括经5‑甲基化修饰或5‑羟甲基化修饰的CpG位点。

本申请公开了一种甲基化标志物。该甲基化标志物包括：以hg19为参考基因组，具有如下所示的染色体区域中的至少之一：1)chr8:57359211‑57359347；2)chr19:45655569‑45655683。其中，该甲基化标志物包括经5‑甲基化修饰或5‑羟甲基化修饰的CpG位点。

本申请涉及引物组、测序文库构建方法、测序方法和试剂盒。该引物组包括：预扩增引物和指数扩增引物，预扩增引物包括：第一预扩增引物和第二预扩增引物；第一预扩增引物和第二预扩增引物分别包括：共同序列、随机序列和固定序列；指数扩增引物包括：指数扩增上游引物和指数扩增下游引物；指数扩增上游引物和指数扩增下游引物分别包括：测序引物接头序列和共同序列；其中，共同序列包括至少部分测序引物序列。采用前述引物组进行测序文库构建，能够将基因组扩增、测序文库构建两步操作合为一步，缩短细胞等起始材料到符合要求测序文库的实验过程。基于前述引物组的一步建库方法，所有操作均在同一管内进行，减少实验误差，避免交叉污染，并减少样本损耗。