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本发明涉及阵列信号处理技术领域，具体而言，涉及一种基于改进Jacobi矩阵分解的MUSIC谱估计方法及系统，本发明利用了稀疏矩阵的特性，充分发挥了矩阵乘法左行右列的特性，在Jacobi矩阵分解方面显著降低了编程复杂度和复用性，通过将阵列信号采集、协方差矩阵构建、Jacobi并行特征分解、特征值排序和谱峰搜索输出集成为一体化硬件结构，便于在FPGA器件中形成连续的测角处理链路；通过设置实扩维协方差矩阵处理结构、并行Jacobi处理结构以及粗搜索和细搜索结合的谱峰搜索结构，便于各处理阶段之间进行接口衔接和并行配合。并且算法全流程采用硬件电路实现，无软件算法的串行执行缺陷，运算速度相比传统串行方案提升显著。