基于Zm00001d047309基因InDel变异的玉米耐碱性分子标记及其应用

本发明涉及一种基于基因InDel变异的玉米耐碱性分子标记及其应用，属于生物技术领域。其中耐碱玉米材料在该位点携带插入片段，碱敏感材料在该位点不携带所述插入片段。所述变异位于玉米B73参考基因组（RefGen_v4）第9号染色体的基因组区域内，与玉米耐碱表型显著相关。基于所述变异位点设计了特异性PCR引物组，所述引物组包括如SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3所示的引物。采用所述引物对待测玉米基因组DNA进行扩增，并通过电泳或测序检测扩增结果，可判定待测材料是否携带与耐碱性相关的插入片段。该分子标记可用于玉米耐碱种质资源鉴定、耐碱材料筛选及分子辅助育种。