一种基于已知参考基因组且无需组装的微生物单细胞基因组物种鉴定方法及系统

本发明提供了一种基于已知参考基因组且无需组装的微生物单细胞基因组物种鉴定方法及系统。本发明无需de novo共组装与bin精修，数据库装载次数由SAG数量级降为常数级，比对次数不随候选物种数膨胀，低覆盖度、低纯度SAG仍可完成物种鉴定，且参考基因组可跨样本本地复用，适用于大规模微生物单细胞测序样本的自动化物种级解析。