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本发明公开了一种复合抗氧化酶协同发酵富集处理方法，包括以下步骤：步骤S1：复合菌种复配与活化；步骤S2：协同发酵体系构建；步骤S3：多参数同步调控发酵；步骤S4：发酵产物分离纯化；步骤S5：稳定化处理；本发明实现了多类抗氧化酶的同步高效合成与富集，通过将产不同抗氧化酶的菌种进行复配，构建多菌种协同发酵体系，利用菌种间的代谢互补与协同促进效应，在同一发酵周期内实现了超氧化物歧化酶、过氧化氢酶及谷胱甘肽过氧化物酶的同步合成与富集，克服了现有单菌种发酵产酶种类单一的技术缺陷，所得酶制剂具有更完整的抗氧化功能谱系。