墨卓生物科技（浙江）有限公司

本发明提供了一种基于差异度特征筛选与多指标聚类质量评估的微生物单细胞菌株鉴定方法。该方法通过差异化SNP特征筛选与多指标聚类质量评估，能够在高噪声、高稀疏性微生物单细胞测序数据中自动、准确鉴定菌株，实现无监督的菌株数自动确定。

本发明提供了一种基于已知参考基因组且无需组装的微生物单细胞基因组物种鉴定方法及系统。本发明无需de novo共组装与bin精修，数据库装载次数由SAG数量级降为常数级，比对次数不随候选物种数膨胀，低覆盖度、低纯度SAG仍可完成物种鉴定，且参考基因组可跨样本本地复用，适用于大规模微生物单细胞测序样本的自动化物种级解析。