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本文提供了用于从包含完整衣壳和空衣壳的AAV起始制剂获得所述AAV完整衣壳的方法。在一些实施方案中，将所述AAV起始制剂施加到阴离子交换色谱（AEX）柱，将包含二价阳离子盐的洗脱缓冲液施加到所述AEX柱，并且从所述阴离子交换色谱柱收集洗脱级分，所述洗脱级分包含比所述AAV空衣壳更大比例的所述AAV完整衣壳。在特定实施方案中，在所述二价阳离子盐洗脱缓冲液之前，将包含单价阳离子盐的洗涤缓冲液施加到所述AEX柱，并且从所述AEX柱洗脱出洗涤级分，所述洗涤级分包含比所述AAV完整衣壳更大比例的所述AAV空衣壳。