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本发明公开了一种转录与翻译协同调控提高人乳铁蛋白产量的重组毕赤酵母菌株及其构建方法与应用。所述重组毕赤酵母菌株在表达人乳铁蛋白的基础上，还过表达选自Mit1、Prm1中的至少一种转录因子和选自Bcy1、Ded81、eEF3、eEF1A中的至少一种翻译相关因子。其中，Mit1转录因子和Bcy1翻译相关因子的协同过表达效果最优，摇瓶发酵120 h人乳铁蛋白产量稳定达136.8 mg/L，10 L发酵罐高密度发酵产量高达1.26 g/L。本发明首次提出并验证了转录和翻译协同调控技术，解决了现有技术中单一调控路径存在的转录与翻译失配问题，为人乳铁蛋白的工业化规模生产提供了高效、可放大的生产新思路。