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本发明涉及洪涝风险评估技术领域，尤其涉及一种基于多源遥感与GIS融合的洪涝风险评估方法及系统，获取目标区域多源遥感数据和地理信息系统数据，反演地表状态参数并提取地形水文结构参数，统一时空分辨率后通过建立反映地表径流生成与汇流传输物理过程的耦合关系进行时空关联融合，生成融合特征场，依据要素对洪涝致灾过程的贡献差异结合降雨产流、坡面汇流、河道演进的物理传递链动态确定作用权重，组合计算得到风险分布并追踪地形连通性和水流路径，生成包含风险等级与传播机制的评估结果，识别风险分布的空间传递方向与影响范围，有效提升洪涝风险评估的精度与可靠性，为防灾减灾提供科学依据。