上海基绪康生物科技有限公司

本发明公开一种基于自适应结合分子性质交叉注意力模型的生物大分子候选分子性质预测与增强发现方法及系统，依次执行数据输入、序列预处理与CDR区域标注、蛋白语言模型PLM分层微调、ABPA交叉注意力建模与强化学习优化、动态阈值虚拟预筛、湿实验验证、实验数据回流迭代、标准化候选清单输出八大步骤。本发明依据不同预测任务自动分配特征权重，同步预测亲和力、表达量、稳定性、细胞活性、聚集风险等多种分子性质；区分早期筛选、先导优化设置差异化筛选阈值，湿实验数据回流形成模型自迭代闭环，搭配MLOps实现全流程可追溯，可缩短抗体、TCE、CAR等生物大分子药物研发周期，适用于工业化多靶点蛋白药物虚拟筛选平台。

本发明公开一种基于抗原‑结合物结构接触图谱的自动化表位分箱方法、系统、设备及存储介质，本发明以实验解析或AlphaFold系列工具预测的复合物结构为输入，经结构预处理、链分类、抗原残基标准化编号，按距离阈值提取接触残基并生成标准化接触图谱；采用最大重叠比例计算相似度，构建加权无向图并过滤低相似边，依托节点连接度迭代聚类自动划分表位分箱，同步输出残基明细、相似度矩阵、结构化文件等可溯源证据。本发明全流程自动化，统一计算标准，消除人工偏差，可高通量处理复合物数据，大幅缩减实验成本与筛选周期，适配抗体、纳米抗体等多种结合物，可用于候选分子排序、抗原逃逸分析、多特异性蛋白设计等场景。