中国农业科学院蔬菜花卉研究所

本发明公开了一种用于鉴定茄子开花时间的InDel分子标记、检测引物对及其应用，属于分子标记辅助育种技术领域。本发明基于圆茄早开花自交系1221和晚开花自交系1223构建的F分离群体，采用QTL‑seq和ED4关联分析，在茄子第2号染色体74,845,435 bp处鉴定获得与开花时间紧密连锁的InDel位点；该位点的两个等位序列如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示，二者存在13bp的插入/缺失差异。针对该位点设计SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4所示检测引物，可对茄子植株进行早开花或晚开花的早期基因型鉴定。在46份F材料中检测准确率为80.4%，在39份不同遗传背景茄子种质资源中检测准确率为82.1%，可用于茄子开花时间的辅助鉴定及早、晚熟育种。

本发明公开了一种蔬菜新品种DUS/VCU多模态评价系统，包括规则配置模块、任务生成模块、数据治理模块、近似品种检索模块、DUS辅助判定模块、VCU预测模块和报告复核模块。本发明将DUS/VCU标准规则转化为可计算任务，并将表型图像、深度数据、光谱数据、环境信息和基因型信息用于近似品种检索、DUS辅助判定和VCU表现预测，从而提高测试效率、客观性和结果一致性。

本申请属于生物检测领域，具体涉及用于检测长孢轮枝菌的引物探针组合、试剂盒、检测方法及其应用。本申请通过长孢轮枝菌与近缘种大丽轮枝菌的比较基因组分析，鉴定了长孢轮枝菌的特异基因组序列VL‑spefic1，该序列能够准确的区分大丽轮枝菌和长孢轮枝菌。根据该特异序列设计了DNA引物和RNA探针，以及EmDEA快速检测方法，该方法操作简便，实验条件要求较低，耗时较短，并且反应试剂等的保存较为简便，可满足不同条件下的检测要求，能够特异性地检测不同来源的长孢轮枝菌，检测其他近似种时无阳性，而且灵敏度很高，非常适用于口岸日常进出口检测及外出实地监测需求，具有较好的应用前景。

本发明公开了一种基于酶介导双重指数扩增的长林小蠹快速检测方法，针对长林小蠹特异性保守基因区段，设计最优扩增组合。该方法可在恒温单管完成核酸双重指数扩增，无需精密变温设备；特异性验证显示仅长林小蠹样本产生阳性荧光信号，与黑胸海小蠹等近缘蠹虫无交叉扩增；灵敏度达10 copies/μL，可检出痕量虫体、蛀屑、木材隐蔽虫态样品。整套检测流程仅 30 min，配套试剂盒 4℃可稳定储存，兼具高灵敏、强特异、便携快速优势，适用于口岸检疫、林间隐蔽虫害现场筛查，可为长林小蠹入侵监测、早期防控提供便捷分子检测手段。