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本文描述了一种分泌分析和分选系统，在该系统中，（一个或多个）细胞被沉积到载体中，该载体将捕获来自细胞的任何分泌物，并且小到足以使用基于流式细胞术的细胞分选进行分选。使用识别载体样本中存在的事件类型的图像分类工作流，允许用户选择其希望纯化的事件类型，然后训练监督分类系统，该监督分类系统将用于作出实时分选决策，以纯化包含分泌期望产物的细胞的载体。随后，流式细胞仪能够用于筛选各个载体，以查看每个载体是否具有期望的分泌产物。

自动标注方法被实现为图像激活式细胞分选仪的一部分。用户输入关于用户正试图纯化的事件的描述性信息。使用无监督聚类对具有相似图像特征的事件进行分组。一旦聚类完成，自动标注算法就使用先验信息和在聚类期间提取的特征来预测每个簇中的事件的身份并对事件进行标注。