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本发明公开了一种应用于工业计算机的工控数据加密传输系统及方法，涉及加密传输异常监测技术领域，所述工控数据加密传输方法具体包括如下步骤，采集历史中工控数据的加密信息，构建数据传输列表；分析所述数据传输列表，获取传输异常特征和工控数据的加密特征；基于所述传输异常特征，通过历史数据构建传输波动模型；基于所述工控数据的加密特征，对工控数据设定不同的加密条件；获取进行完加密的工控数据的传输异常特征值，通过传输异常特征值的差异性进行传输风险评估。本发明能够有效提升工控数据传输的安全性、稳定性和效率，降低加密对系统性能的影响，并在传输异常时提供预警和调整措施，为工业控制系统提供更可靠的数据保护机制。