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本发明公开了一种基于Web服务的云端集成软件运行支撑方法及系统，涉及医疗协同诊断技术领域，本发明包括以下步骤：构建双通道事件采集管道，捕获两类交互动作并转化为结构化原子事件；构建共享因果解耦表征空间，编码两类事件序列并解耦为不变属性编码与因果属性编码；引入结构因果模型，构建含操作节点与实体节点的有向无环图，确立因果依赖方向；基于反事实注意力机制，构建事实与反事实上下文状态，通过对比量化操作事件与修改事件间的因果效应强度；生成因果关联链路，依因果强度筛选强因果对构建溯源链路，将关联数据与原始流哈希加时戳固化；当协同会话出现诊断结论分歧时，系统能够自动回溯并定位哪一具体操作是导致结论修改的根本原因。