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本发明公开了一种运动负荷自适应调控方法及系统，其包括获取目标对象在康复运动过程中的心电信号数据和运动状态数据；对心电信号数据依次进行小波多层分解和小波重构处理，得到基线校正信号；将运动状态数据作为参考噪声输入，基于变步长自适应滤波算法对基线校正信号进行非平稳伪影抵消，得到高保真心电信号；分别对高保真心电信号和运动状态数据进行特征提取，得到心肌缺血关联特征和运动关联特征；将心肌缺血关联特征、运动关联特征和目标对象画像向量进行拼接处理，构建多维风险向量；将多维风险向量输入模糊推理模型中，得到目标对象的当前风险等级，并生成对应的负荷调控指令。本发明的方法，提升了康复训练的安全性与有效性。