一种畜禽经济性状候选功能位点识别方法、平台及介质

本发明提供一种畜禽经济性状候选功能位点识别方法、平台及介质。获取畜禽群体表型及多源基因型数据，经表型质控、基因型一致化、按需填充和基因型质控后，构建含待检验SNP效应项的线性混合模型开展全基因组关联分析。基于连锁不平衡过滤所得独立有效SNP数确定显著性阈值并筛选显著SNP，按染色体位置和物理距离自动合并显著关联峰、扩展并合并形成候选定位区间。提取区间内关联汇总统计量和连锁不平衡矩阵，经SNP坐标、等位基因方向及排列顺序一致性校验后进行精细定位，获得后验包含概率和可信集；结合位点功能类别确定候选变异的优先级，并将基因内变异映射至所在基因、基因间区变异映射至相邻基因，实现候选功能位点自动化识别。