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本发明属于药物组合物制备技术领域，具体为一种治疗腺体类散结节的药物组合物及其制备方法。治疗腺体类散结节的药物组合物包括中药组合部分和西药组合部分；其中，中药组合部分包括疗效组分一、疗效组分二和疗效组分三，西药组合部分包括功能组分一、功能组分二和功能组分三。治疗腺体类散结节的药物组合物的制备方法包括以下步骤：称取功能组分一、功能组分二和功能组分三，将功能组分一、功能组分二和功能组分三中的原料分别混合均匀制成胶囊，形成单组分胶囊包芯西药；称取疗效组分一、疗效组分二和疗效组分三原料独立混合均匀制成凝胶药；对胶囊用凝胶药进行多层包覆。本发明通过将中药成分和西药成分结合来治疗腺体类散结节，采用多层包裹使不同疗效的药物在不同时间段在胃内溶解，解决了单一种类药物治疗效果不佳，中西结合药物没有较佳组合方式等问题。