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本发明属于城市公共交通规划技术领域，公开了一种混行交通中的公交专用道设置方法及装置，所述方法包括步骤：根据路段基础数据，搭建私家车与公交车混合交通运行的宏观仿真模型，根据宏观仿真结果，判断设置公交专用车道的最佳道路服务水平区间；根据路网基础数据，搭建私家车与公交车混合交通运行的微观仿真模型；在原网络方案和全设置公交专用道网络方案的基础上，判断私家车与公交车混合交通网络优化设计问题需要决策的问题，并搭建两阶段模型予以描述；求解所述两阶段模型。本发明通过仿真路网状态不断调整公交专用道设置方案，输出的最佳的公交专用道设置方案，可以使路网效益达到最优。