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本发明公开了一种水位数据采集与分析方法及系统，涉及水利工程监测技术领域，通过监测截面垂直布设水压敏感变形杆，采集水位光纤数据，所述水位光纤数据包括第一光纤序列和第二光纤序列；通过双模差分算法对水位光纤数据进行温度偏差处理，得到净应变序列；获取历史静水压力数据，对净应变序列进行空间导数分析映射，得到实际水位数据；利用综合重构网络模型对实际水位数据进行奇异值分解，得到水位基准序列；基于水位基准序列构建水动力模型，得到模拟水位误差，构建线性回归与比例缩放校正模型，对全流域模拟水位进行实时矫正，得到矫正后流量数据，并输入CKLSTM深度预测网络，输出入库洪水流量和风险预警结果，显著缩短了预警响应时间。