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公开了用于改进的dPCR系统和方法的各种实施例。一些实施例提供一种多仪器dPCR系统，该系统便于在多个分区阵列、多个样本板和/或多个仪器之间协同分析样本，从而提供一个更优异且更高通量的dPCR系统。各种实施例的各方面提供以下一项或多项：照明偏差校正；质量控制处理；用于跨分区、样本板和仪器进行阈值设置和分析的灵活样本分组；每个染料通道的仪器间信号均衡，以便于跨仪器对样本进行分组；以及改进的自动阈值化功能。

公开了具有改进的自动阈值性能和准确性的数字聚合酶链反应(dPCR)系统和方法的实施例。本公开的一个实施例包括dPCR处理模块，该模块包括自动阈值代理，其动态分析并在高斯混合模型(GMM)和K均值聚类之间进行选择，以用于使用dPCR仪器的dPCR测定的自动阈值结果，以改善dPCR测量技术。

本文公开的实施例包括数字聚合酶链反应（dPCR）操作系统，其采用数字图像处理方法，用于校正与样本板阵列相关的数据中的光照偏差，所述样本板包含一个或多个样本分区阵列。在一些实施例中，该方法包括：获取dPCR系统在dPCR检测的背景循环后通过相机采集的数字图像所对应的背景图像数据。针对每个分区，推导局部平场校正系数并将其应用于背景图像数据，以获得经局部偏差校正的背景图像数据。然后，使用局部‑偏差‑校正背景数据确定全局平场校正系数集。随后联合使用局部与全局平场校正系数对终点图像数据进行光照偏差校正，生成经偏差校正的终点照度值。