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本发明公开一种抗褐变高纯度丙酮酸钠的制备方法，S1、将丙酮酸溶于水，加入碱性钠源中和反应，获得丙酮酸钠中和液；S2、向丙酮酸钠中和液中加入活性炭脱色，过滤，获得预脱色液；S3、重将预脱色液通过填充有螯合树脂的第一色谱柱，螯合树脂选用亚氨基二乙酸型螯合树脂或氨基膦酸型螯合树脂；S4、将步骤S3的流出液通过填充有强碱性阴离子交换树脂的第二色谱柱，强碱性阴离子交换树脂的功能基团为季铵基，用于选择性吸附流出液中的氯离子；S5、将步骤S4的流出液减压浓缩，加入反溶剂结晶，得到结晶混合物；S6、将结晶混合物分离，固体用洗涤液洗涤，得到丙酮酸钠湿品；S7、将丙酮酸钠湿品在减压条件下干燥，得到高纯度丙酮酸钠成品。