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本发明公开了水稻基因在提高水稻淹水萌发能力中的应用和方法，通过基因工程构建该基因的过表达载体并转化水稻，获得过表达植株。研究证实基因正向调控水稻的淹水萌发能力，过表达植株在淹水胁迫条件下胚芽鞘伸长优势显著，根系活力与幼苗生物量均明显优于野生型植株，本发明为耐淹型水稻萌发性状分子育种提供了核心基因。