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本发明公开了鲍曼不动杆菌疫苗抗原Ata片段蛋白的蛋白发酵、纯化及制备工艺，包括如下步骤：S1：通过摇瓶进行接种培养；S2：收集菌体；S3：破碎菌体，并进行离心澄清；S4：阴离子层析；S5：疏水层析；S6：脱盐换液；S7：得到高纯度Ata片段蛋白。本发明建立了小试规模菌种发酵到分离纯化工艺，利用阴离子交换和疏水层析、超滤等方法的组合，最终得到产量为~g级的蛋白样品，蛋白纯度达99%。