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本发明公开了一种基于FPGA的双归属PON保护心跳监测系统，所述监测系统在组成双归属对的两台OLT设备上，分别配置FPGA芯片，所述FPGA芯片设置成连接OLT设备的PON MAC芯片、交换芯片和CPU，并配置成对组成双归属对的OLT设备形成心跳监测与倒换交互监测和处理。本方案通过FPGA芯片保持和监测双归属对间的心跳和倒换交互报文，通过快速并行操作，及时准确的感知心跳状态，并能在收到倒换请求后快速发起倒换，无需CPU的干预，增加了心跳感知、PON倒换的及时性和准确性，提高了双归属PON保护功能的收敛速度和效率。