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本发明公开了一种利用水生植物残体制备育苗基质的方法，属于农业废弃物资源化与环保技术交叉领域。本发明创新性地通过机械压榨将水生植物残体分离为“固形物”与“压榨液”两条独立物料流；然后，根据两者的物理化学特性的根本差异，分别设计了“限氧催化炭化”与“复合菌剂定向发酵”这两条最优化的转化路径；最终，将转化所得的功能性产物（生物炭与有机液肥）在造粒环节进行集成，创制出统一的、高性能的育苗基质产品。本发明的核心价值在于实现了废弃物的全量化、高值化利用，形成了无二次污染且资源可循环再生的完整技术闭环。