一种用于鉴定‘桂早红油桔’的CAPS分子标记及其应用

本发明涉及分子标记辅助育种技术领域，本发明的目的之一在于提出一种用于鉴定‘桂早红油桔’的CAPS分子标记，所述标记位于香港金柑基因组第6号染色体第26,487,151至26,487,152位点；‘桂早红油桔’在所述位点存在2bp的杂合缺失，所述缺失使得断点两侧序列重新拼接后形成限制性内切酶Tsp45Ⅰ的酶切位点；所述缺失片段的核苷酸序列如SEQIDNO.1所示。本发明的目的之二在于提出用于检测所述CAPS分子标记的引物对，所述引物对的正向引物核苷酸序列如SEQIDNO.2所示，反向引物核苷酸序列如SEQIDNO.3所示。发明提供的CAPS分子标记基于‘桂早红油桔’特有的2bp（TA）杂合缺失位点开发，经24份金柑品种/品系（涵盖金弹、罗纹、罗浮、长寿金柑、四季橘、香港金柑等多个种和品种类型）盲测验证。