一种用于鉴定茄子开花时间的InDel分子标记、引物对及其应用

本发明公开了一种用于鉴定茄子开花时间的InDel分子标记、检测引物对及其应用，属于分子标记辅助育种技术领域。本发明基于圆茄早开花自交系1221和晚开花自交系1223构建的F分离群体，采用QTL‑seq和ED4关联分析，在茄子第2号染色体74,845,435 bp处鉴定获得与开花时间紧密连锁的InDel位点；该位点的两个等位序列如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示，二者存在13bp的插入/缺失差异。针对该位点设计SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4所示检测引物，可对茄子植株进行早开花或晚开花的早期基因型鉴定。在46份F材料中检测准确率为80.4%，在39份不同遗传背景茄子种质资源中检测准确率为82.1%，可用于茄子开花时间的辅助鉴定及早、晚熟育种。