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一种基于唯一分子标记符和文库扩增定量控制的环状RNA全长测序方法
발명유효
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§ Ⅰ
개요
발명자
杨恩策; 金岳圻; 胡雪嫣
IPC 분류
C12Q 1/6869 (2018.01)C12Q 1/6806 (2018.01)G16B 30/10 (2019.01)
本发明涉及生物技术领域,具体提供一种环状RNA(circRNA)全长测序方法。该方法包括:对RNA样本进行rRNA去除、poly(A)加尾及RNase R处理以富集circRNA;通过带唯一分子标记符(UMI)的特定引物进行逆转录和双链cDNA合成;在实时荧光定量PCR指导下确定最佳扩增循环数以构建文库;经三代测序(TGS)平台进行长读长测序;结合UMI聚类与循环一致性序列生成,采用ucRG算法实现circRNA全长结构识别和定量分析。本发明能够降低扩增偏倚和测序误差,提高circRNA识别的准确性和特异性,显著改善TGS与二代测序(NGS)平台在circRNA检测结果上的一致性,具有较高的灵敏度和定量可靠性,可广泛应用于环状RNA的基础研究和临床检测。