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案件記録

一种麒麟菜的Hi-C高通量测序建库方法

発明有効
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§ Ⅰ

案件概要

発明者

郑洪坤; 陈钰萌; 毕经德; 张雪川

IPC分類

C12Q 1/6806 (2018.01)C12Q 1/6869 (2018.01)C12Q 1/6895 (2018.01)C40B 50/06 (2006.01)C40B 40/06 (2006.01)C12R 1/89 (2006.01)

本发明涉及生物信息学技术领域,尤其涉及一种麒麟菜的Hi‑C高通量测序建库方法。该方法包括:前处理、甲醛交联、细胞裂解和酶切;前处理包括:通过物理刮除的方式去除麒麟菜表面的粘液;剪成小块后,采用干扰物清洗试剂、乙醇和水依次清洗;干扰物清洗试剂以水为溶液,包括:Tris‑HCl、EDTA丙三醇和PEG8000。本发明针对麒麟菜提供一种专有的Hi‑C高通量测序建库方法,通过特定的前处理流程处理麒麟菜表面的蜡质层,可以有效降低后续细胞裂解之后样本中多糖、多酚、矿物质以及多种内源性抑制物等杂质的水平,还能够尽可能保持细胞核的完整性,进而可以构建得到极高质量(尤其是高有效数据量)的麒麟菜Hi‑C文库。

外部リソース