一种鉴定蝾螈和爪蟾间肢体再生异质性的方法

本发明提出了一种鉴定蝾螈和爪蟾间肢体再生异质性的方法，涉及生物技术领域。包括如下步骤：分别提取蝾螈、爪蟾于不同阶段的样品，对其进行RNA提取和高通量测序，得到原始数据；评估原始数据质量,并对原始数据进行质控，去除低质量碱基或接头污染序列；构建蝾螈参考基因组索引，将质控后的数据和参考基因组进行比对，输出比对数据；从比对数据中输出原始count矩阵，并在R语言环境下，使用原始count矩阵计算TPM值；使用序列比对，提取出蝾螈和爪蟾的共同基因；对获取的数据进行主成分分析和相关性分析。本发明通过转录组分析和测序，分析出了蝾螈与爪蟾肢体再生能力异质性的分子机制，为其他再生能力的研究提供了指导。