水牛全基因组20k液相SNP芯片及设计方法和应用

本发明属于动物分子生物学技术及动物遗传育种技术领域，特别涉及水牛全基因组20k液相SNP芯片及设计方法和应用，芯片包含24893个SNP分子标记；本发明联合应用四种选择信号分析（F、Pi_ratio、XP‑CLR、XP‑EHH）对11个水牛群体对比组合进行筛选，确保位点兼具高信息量与群体普适性，通过多轮质控和功能注释，最终精选24893个SNP位点，均衡覆盖全基因组，显著降低冗余度；本发明基于11个中国主要水牛品种（含沼泽型与河流型）的115个样本数据，确保芯片适用于多品种水牛群体，突出品种鉴定、亲缘分析、遗传多样性监测等应用优势。