一种水稻耐淹基因ARF9的单倍型鉴定标记及其应用

本发明涉及植物基因工程技术领域，且公开了一种水稻耐淹基因的单倍型鉴定标记及其应用。本发明分子标记来自基因的外显子，位于水稻第4号染色体第22009082bp、22010019bp，碱基为C，所述SNP分子标记与多年生稻的父本长雄野生稻（）耐淹水性相关，位点基因型为CC的父本长雄野生稻的耐淹水性显著强于位点基因型为非AA型的水稻。因此本发明提供了一种用于快速鉴定基因单倍体分子标记的环介导等温扩增引物组，用于鉴定基因单倍体分子标记以快速筛选出耐淹水的水稻。本发明提供了一组引物，采用该引物进行环等温反应能快速鉴定出耐淹水稻，并且检测成本低，检测速度快，采用本发明提供的方法能快速在水稻苗期筛选出耐淹种质，无需等到后期进行耗时的淹水试验，极大加速育种进程。