一种应用于多倍体三维基因组数据拆分分析方法

本发明提供一种应用于多倍体三维基因组数据拆分分析方法，步骤如下：S1、应用高通量测序平台获取Hi‑C数据，将数据接头去除并过滤低质量序列；S2、识别reads上的酶切位点并修剪掉下游序列；S3、使用bowtie2软件以‑k’n’为参数单端比对参考基因组，将对比结果进行筛选，若Reads最多n个比对位点中仅有一个没有mismatch，则该条reads与对应比对位点保留；S4、筛选双端均保留的reads，并将双端reads配对，整理互作信息，去PCR冗余后构建互作矩阵并校正，获取互作图谱，即完成多倍体三维基因组数据拆分分析。本方法通过优化比对参数，增加后续序列辨认筛选策略，准确区分同源染色体间的表观数据，达到了对同源多倍体或分型基因组同源染色体间表观遗传结构的准确区分，并提高了数据比对率。