靶点-配体结合自由能计算方法及系统

本申请涉及一种靶点‑配体结合自由能计算方法及系统。方法包括：基于配体‑靶点相互作用梯度驱动机制，实时计算配体与靶点结合口袋残基之间的相互作用力梯度向量并生成候选局部构象；通过显式溶剂分子动力学获取采样结果；通过隐式溶剂模型计算得到每个候选局部构象的溶剂化能；基于溶剂化能逐帧计算采样结果中所有帧的结合自由能；将所有帧的结合自由能均化处理得到每个候选局部构象的结合自由能；将每个候选局部构象的结合自由能进行评估获取稳定性权重和能量权重，归一化处理得到所需要的权重；基于权重及每个候选局部构象的结合自由能加权平均计算所需要的结合自由能。本申请提升了结合自由能计算的准确性与可靠性。